【佳學(xué)基因檢測】我身體健康,基因檢測發(fā)現(xiàn)了什么?
基因檢測導(dǎo)讀:
本文展示了一個(gè)健康的受檢者通過致病基因鑒定基因檢測所獲得的結(jié)果。該受檢者人處中年,身體、健康、智力優(yōu)秀。但是擔(dān)心在未來的生活中會(huì)出現(xiàn)難以預(yù)料的健康風(fēng)險(xiǎn)。于是選擇佳學(xué)基因致病基因鑒定基因檢測。通過本檢測,該受檢者腫瘤與癌癥風(fēng)險(xiǎn)為低。同時(shí)存在一些不太重要的健康風(fēng)險(xiǎn)。預(yù)期會(huì)有一個(gè)健康的后期生活。
檢測發(fā)現(xiàn)攜帶部分常染色體隱性基因,為消除后代患病風(fēng)險(xiǎn),強(qiáng)列建議后代子?jì)D及其配偶進(jìn)行相關(guān)位點(diǎn)和基因的檢測,以確保后代健康。
我的基因突變列表發(fā)現(xiàn)了以下致病性突變
突變1:
突位位點(diǎn)及高精度座標(biāo)
HDC | chr15-50546389-50546389 | NM_002112 | exon6 | c.658C>T | p.R220X | het | 0.00001315 | Pathogenic | AD | 多動(dòng)穢語綜合征,易感({Gilles de la Tourette syndrome,susceptibility to}[OMIM:137580]) | - | 穢語癥;運(yùn)動(dòng)抽搐;抽泣;注意力不集中性多動(dòng)癥;強(qiáng)迫癥 |
2、該基因突變?yōu)槭裁磿?huì)影響身體健康?
這個(gè)突變是指 HDC基因的一個(gè)突變,具體位置在 chr15-50546389-50546389,類型為 c.658C>T,導(dǎo)致 p.R220X(氨基酸精氨酸220位置的變化變成了終止密碼子)。根據(jù)這個(gè)信息,我們討論的應(yīng)該是 HDC基因的突變,而不是BRCA1基因。
HDC基因及其功能:
HDC(組胺脫羧酶,Histidine Decarboxylase)基因負(fù)責(zé)合成組胺,它在神經(jīng)系統(tǒng)、免疫反應(yīng)和胃酸分泌等多種生理過程中發(fā)揮重要作用。組胺是一種神經(jīng)遞質(zhì),參與調(diào)節(jié)過敏反應(yīng)、胃腸功能以及神經(jīng)系統(tǒng)的某些功能。
p.R220X突變對(duì)健康的影響:
-
提前終止的影響:這個(gè)突變導(dǎo)致第220位的精氨酸變?yōu)榻K止密碼子,可能會(huì)導(dǎo)致蛋白質(zhì)過早中止合成,從而形成一個(gè)功能不完全的組胺脫羧酶。最終的蛋白質(zhì)可能不具備正常的生物學(xué)功能。
-
可能的健康影響:
-
組胺合成減少:組胺在免疫系統(tǒng)、神經(jīng)系統(tǒng)中有重要作用。如果HDC基因突變導(dǎo)致組胺合成減少,可能會(huì)影響這些系統(tǒng)的功能。比如,可能導(dǎo)致過敏反應(yīng)減弱(因?yàn)榻M胺在過敏反應(yīng)中扮演關(guān)鍵角色),或者胃腸功能受損(組胺對(duì)胃酸分泌有調(diào)節(jié)作用)。
-
神經(jīng)系統(tǒng)癥狀:由于組胺在中樞神經(jīng)系統(tǒng)中作為神經(jīng)遞質(zhì)發(fā)揮作用,HDC基因的突變可能會(huì)影響與睡眠、警覺性、學(xué)習(xí)和記憶相關(guān)的功能。
-
-
遺傳效應(yīng):如果該突變是致病性突變,可能導(dǎo)致組胺缺乏癥,這是一種極為罕見的疾病,可能導(dǎo)致過敏反應(yīng)的缺失、胃腸問題(如胃酸分泌減少)、或者神經(jīng)系統(tǒng)相關(guān)的癥狀。
臨床建議:
-
如果此突變被證實(shí)有致病性,可能需要通過基因咨詢了解具體的風(fēng)險(xiǎn),尤其是如果出現(xiàn)與免疫或神經(jīng)系統(tǒng)相關(guān)的癥狀時(shí)。
-
對(duì)于癥狀較為明顯的患者,可能需要進(jìn)行一系列的臨床檢查(如過敏反應(yīng)、胃腸功能檢測等)。
總的來說,這個(gè)突變影響的是組胺脫羧酶的功能,可能會(huì)導(dǎo)致與免疫反應(yīng)、神經(jīng)遞質(zhì)調(diào)節(jié)等方面相關(guān)的健康問題。
3、臨床病例相關(guān)性分析
根據(jù)《基因序列變化與人體疾病表征》及國際數(shù)據(jù)庫記載
HDC
(W317X)
|
Single nucleotide variant
(nonsense)
|
Tourette syndrome |
Pathogenic
|
該位點(diǎn)位變化是致病基因。我的蛋白質(zhì)終止位點(diǎn)早于數(shù)據(jù)庫記錄的位點(diǎn),產(chǎn)生的的蛋白質(zhì)功能丟失,應(yīng)比所報(bào)道的病例嚴(yán)重。據(jù)此判斷,該位點(diǎn)為致病性位點(diǎn)。
4、相關(guān)身體與疾病表征介紹
抽動(dòng)癥(Tourette syndrome,TS),又叫圖雷特綜合癥,是一種神經(jīng)系統(tǒng)疾病,通常表現(xiàn)為反復(fù)出現(xiàn)的、無意識(shí)的、無法控制的運(yùn)動(dòng)性抽動(dòng)和/或語言性抽動(dòng)。這些抽動(dòng)通常在兒童時(shí)期(通常在5到10歲之間)首次出現(xiàn),并可能持續(xù)到成年。
主要癥狀:
-
運(yùn)動(dòng)性抽動(dòng):患者會(huì)不自覺地做出一些快速、重復(fù)、刻板的動(dòng)作,例如眨眼、聳肩、咳嗽、搖頭、擺動(dòng)四肢等。這些動(dòng)作通常會(huì)在沒有目的的情況下突然發(fā)生。
-
語言性抽動(dòng):患者可能會(huì)說出一些不適當(dāng)或不合時(shí)宜的詞語,甚至是臟話(這叫做臟話抽動(dòng),也是抽動(dòng)癥的一個(gè)典型表現(xiàn),但并不是所有患者都會(huì)有臟話抽動(dòng))。此外,患者也可能會(huì)重復(fù)某些話語、聲音,或不自覺地發(fā)出某些聲音。
癥狀特點(diǎn):
-
反復(fù)性:抽動(dòng)是反復(fù)的,通常一天內(nèi)會(huì)多次發(fā)生。
-
不可控制性:患者通常意識(shí)到自己的抽動(dòng)行為,但無法控制它們。
-
癥狀波動(dòng)性:抽動(dòng)癥的癥狀可能會(huì)隨著時(shí)間波動(dòng),某些時(shí)候可能加重,某些時(shí)候可能減輕。通常在壓力大或情緒激動(dòng)時(shí)癥狀會(huì)更明顯。
-
年齡起始:抽動(dòng)癥通常在兒童期發(fā)病,男性患者的發(fā)病率較女性更高。
病因:
抽動(dòng)癥的確切原因尚不完全明確,但通常認(rèn)為與以下因素相關(guān):
-
遺傳因素:抽動(dòng)癥有一定的遺傳傾向。如果家庭中有類似病史,子女患病的風(fēng)險(xiǎn)較高。
-
神經(jīng)生物學(xué)因素:大腦中特定神經(jīng)遞質(zhì)(如多巴胺)的異常被認(rèn)為與抽動(dòng)癥的發(fā)生有關(guān)。
-
環(huán)境因素:一些環(huán)境因素(如感染、壓力或其他生理因素)也可能對(duì)癥狀的發(fā)生和加重起到一定作用。
治療:
目前沒有根治抽動(dòng)癥的方法,但可以通過一些治療手段來緩解癥狀:
-
行為治療:如習(xí)慣反轉(zhuǎn)訓(xùn)練(CBIT),幫助患者學(xué)會(huì)控制抽動(dòng)。
-
藥物治療:一些藥物(如抗精神病藥、抗抑郁藥等)可以幫助減少癥狀,特別是在癥狀嚴(yán)重影響到生活質(zhì)量時(shí)。
生活影響:
-
社交影響:由于抽動(dòng)癥患者的癥狀可能引起他人的誤解或歧視,可能導(dǎo)致患者出現(xiàn)自卑、焦慮等情緒問題,影響社交活動(dòng)。
-
學(xué)業(yè)和職業(yè):一些患者的癥狀可能影響他們在學(xué)?;蚬ぷ髦械谋憩F(xiàn),但大多數(shù)患者在接受治療和適應(yīng)后能夠有正常的社交和工作生活。
總結(jié)來說,抽動(dòng)癥是一種以反復(fù)性、不自主的運(yùn)動(dòng)和語言性抽動(dòng)為特征的神經(jīng)發(fā)育性疾病,雖然沒有根治的方法,但通過早期干預(yù)和適當(dāng)?shù)闹委?,患者能夠有效地管理癥狀,過上較為正常的生活。
位點(diǎn)二
1、突變位置及其高精度座標(biāo)
WHRN | chr9-117186718-117186718 | NM_015404 | exon6 | c.1312G>T | p.E438X | het | 0 | Pathogenic | 1.AR 2.AR | 1.常染色體隱性遺傳耳聾31型(Deafness,autosomal recessive 31[OMIM:607084]) 2.Usher綜合征IID型(Usher syndrome,type 2D[OMIM:611383]) | - | 1.感音神經(jīng)性聽力障礙; 2.感音神經(jīng)性耳聾;視網(wǎng)膜色素變性;視野收縮;視力障礙 | - | 1.眼科系統(tǒng);2.耳聾系統(tǒng); | 1.視網(wǎng)膜疾病;2.常染色體隱性非綜合征型耳聾; |
2、基因檢測結(jié)果解讀
基因突變描述:
-
基因:WHRN
-
染色體位置:chr9-117186718-117186718
-
轉(zhuǎn)錄本:NM_015404
-
外顯子:外顯子6(exon6)
-
突變類型:c.1312G>T
-
氨基酸變化:p.E438X(谷氨酸在438位置發(fā)生替換,變成終止密碼子,形成提前終止)
-
基因型:雜合突變(het)
突變類型與影響:
-
突變性質(zhì):這是一個(gè)錯(cuò)義突變(nonsense mutation),突變導(dǎo)致編碼蛋白的提前終止,形成截短的蛋白質(zhì)。這樣通常會(huì)導(dǎo)致蛋白質(zhì)功能喪失或失效。
-
氨基酸變化:谷氨酸(Glutamic acid, E)在第438位置被突變?yōu)榻K止密碼子(X),這使得蛋白質(zhì)在此位置提前終止,導(dǎo)致一個(gè)不完整的、功能受損的蛋白質(zhì)。
致病性和相關(guān)疾?。?/h4>
該突變被標(biāo)注為致病性(Pathogenic),并與以下兩種疾病相關(guān):
-
常染色體隱性遺傳耳聾31型(Deafness, autosomal recessive 31,OMIM: 607084):
-
遺傳方式:常染色體隱性遺傳(AR)。
-
疾病描述:這是由WHRN基因突變引起的一種耳聾類型?;颊咄ǔT诔錾蟛痪镁捅憩F(xiàn)出聽力喪失。該疾病是由于WHRN蛋白的缺失或功能喪失,影響內(nèi)耳的正常發(fā)育和功能。
-
突變影響:如果患者從父母各繼承一個(gè)突變的基因拷貝,通常會(huì)導(dǎo)致耳聾。單純的雜合突變者通常不會(huì)表現(xiàn)出臨床癥狀,但他們可能是該疾病的攜帶者。
-
-
Usher綜合征IID型(Usher syndrome, type 2D,OMIM: 611383):
-
遺傳方式:常染色體隱性遺傳(AR)。
-
疾病描述:Usher綜合征是一種導(dǎo)致耳聾和視網(wǎng)膜色素變性(RP)的遺傳性疾病。II型Usher綜合征是最常見的一種類型,患者通常在出生時(shí)即出現(xiàn)聽力喪失,隨著時(shí)間推移,可能會(huì)發(fā)展為視力喪失。該疾病的原因是WHRN基因的突變,影響內(nèi)耳和眼睛的感光細(xì)胞。
-
突變影響:WHRN基因突變會(huì)導(dǎo)致蛋白質(zhì)功能缺失,影響內(nèi)耳的結(jié)構(gòu)和眼睛的功能,導(dǎo)致耳聾和視力喪失。
-
診斷與遺傳咨詢:
-
遺傳模式:該突變?yōu)槌H旧w隱性遺傳,需要兩份突變的拷貝才能表現(xiàn)出疾病癥狀。因此,患者必須從父母雙方各繼承一個(gè)突變基因才能表現(xiàn)出臨床癥狀。若父母雙方都是雜合子攜帶者,子代有25%的機(jī)會(huì)表現(xiàn)出疾病。
-
健康影響:患者可能會(huì)表現(xiàn)出先天性耳聾,并且隨著年齡的增長,可能出現(xiàn)視力喪失,最終導(dǎo)致視覺和聽覺功能的喪失。
臨床建議:
-
對(duì)于確認(rèn)該突變的個(gè)體,建議進(jìn)行基因咨詢,了解遺傳風(fēng)險(xiǎn),并為家族成員提供進(jìn)一步的遺傳篩查。
-
定期進(jìn)行聽力檢查和眼科檢查,以便早期發(fā)現(xiàn)和監(jiān)測相關(guān)癥狀(如視網(wǎng)膜色素變性)。
-
若患者癥狀明顯,可能需要配合助聽器或耳蝸植入等治療方法改善聽力,并考慮視力保護(hù)和其他支持性治療。
總結(jié):
該WHRN基因的c.1312G>T突變是一個(gè)導(dǎo)致耳聾(Deafness, AR31)和Usher綜合征Ⅱ型(Usher syndrome, type 2D)的致病性突變,屬于常染色體隱性遺傳。攜帶者通常無癥狀,但若父母雙方為攜帶者,子女有25%的機(jī)會(huì)患病。
若受檢者有生育的計(jì)劃和安排,需對(duì)配偶做WHRN全長基因檢測,以排除在同樣的位點(diǎn)存在同樣的突變的可能。同時(shí)應(yīng)當(dāng)排除配偶在該基因的其他位置存在致病性或可能致病的突變。若存在上述兩種情況,再次生育的子女具有先天性耳聾的風(fēng)險(xiǎn)。受檢者需持本報(bào)告及配偶的基因檢測報(bào)告,向生殖中心提出胚胎植入前篩選的要求。若風(fēng)險(xiǎn)生育,所生育子女最大有25%的先天性耳聾的可能。
若受檢者沒有生育計(jì)劃,應(yīng)對(duì)已生育子女及其配偶進(jìn)行該位點(diǎn)或WHRN全長基因的檢測。以排除該基因位點(diǎn)在后代中攜帶并生育先天性耳聾的可能。
其他應(yīng)當(dāng)注意并與受檢者的實(shí)際表現(xiàn)進(jìn)行驗(yàn)證的突變
1、基因突變信息及高精度突變坐標(biāo)
ZP3 | chr7-76062300-76062300 | NM_007155 | exon4 | c.335C>T | p.T112M | het | 0.0001 | Likely pathogenic | AD | 卵母細(xì)胞/受精卵/胚胎成熟停滯3型(Oocyte maturation defect 3[OMIM:617712]) | - | 不孕癥;卵母細(xì)胞變性;卵母細(xì)胞缺乏透明帶 | - | - | - |
表中所述位點(diǎn)與女性生殖有關(guān),但受檢者是男性,應(yīng)不表現(xiàn)出疾病癥狀。但該基因有可能傳遞給送檢者的女兒。女兒在備孕前應(yīng)對(duì)該位點(diǎn)進(jìn)行檢測。若出現(xiàn)生育困難或延遲,應(yīng)立即檢測,以排除該基因位點(diǎn)或其他突變位點(diǎn)對(duì)生育的影響,以便及時(shí)、有效備孕。
基因解碼深度分析
NQO2 | chr6-3019840-3019840 | NM_000904 | exon7 | c.647G>A | p.W216X | het | 0.0004 | Uncertain | AD,SMu | 乳腺癌({?Breast cancer susceptibility}[OMIM:114480]) | - | 乳腺癌;導(dǎo)管癌;小葉癌 | HP:0002664(腫瘤) | - | - |
受檢者的部分NQO2是喪失功能的蛋白質(zhì),增加了受檢者的乳腺癌風(fēng)險(xiǎn)。但本受檢者是男性,癌癥或腫瘤風(fēng)險(xiǎn)較低。當(dāng)該位點(diǎn)與其他癌癥突變位點(diǎn)風(fēng)險(xiǎn)同時(shí)存在時(shí),受檢者的風(fēng)險(xiǎn)會(huì)顯著升高。該突變?yōu)殡s合突變,而且常常在體細(xì)胞突變中檢出。因此,受檢者應(yīng)注意癌癥相關(guān)環(huán)境與飲食因素,避免讓另一拷貝突變。同時(shí)應(yīng)避免環(huán)境因素導(dǎo)致的其他突變增加癌癥風(fēng)險(xiǎn)。
(責(zé)任編輯:佳學(xué)基因)